一、病原的不同
豬細菌性疾病的病原是細菌，豬病毒性疾病的病原是病毒。病毒是極其微小的生物體。細菌比病毒大了許多。利用細菌為人類服務早在有人類文明就開始了，目前為止利用病毒為人類服務的很少。不過在豬上面應用有一例：英國萊斯特大學的Martha Clokie教授將帶領團隊研究使用病毒來治療豬的細菌性感染。
二、發病的病程不同
豬細菌性疾病發病的病程一般較短，發病急。豬病毒性疾病發病的病程一般較長，需要潛伏一星期左右發病。
三、致死性不同
豬細菌性疾病一般會造成豬只死亡;豬病毒性疾病一般很少造成豬只死亡，但由其引發的并發癥往往是致命的。
四、病豬發病量不同
豬細菌性疾病發病豬發病數量一般少，不集中;豬病毒性疾病發病豬發病數量一般較大，并快速擴散。
五、發病豬體溫變化不同
豬細菌性疾病發病豬體溫一般較高，張弛熱型;豬病毒性疾病發病豬體溫一般稍高，稽留熱型。
六、死亡豬的體況不同
豬細菌性疾病發病死亡豬的體況一般較肥，豬病毒性疾病發病死亡豬的體況一般較消瘦。
七、病豬糞便不同
豬細菌性疾病發病豬糞便一般單一顏色的糊狀成分為主;豬病毒性疾病發病豬糞便一般多種顏色，水樣成分。細菌性腹瀉的糞便一般為堿性，病毒性腹瀉的糞便呈酸性。凡細菌性疾病，它攻擊對象是不分種類的，常見的是人，豬，狗，禽交叉感染。病毒攻擊對象是分種類的，豬的不一定感染狗，就像人不得豬瘟一樣。
八、病豬病變特點不同
豬細菌性疾病發病豬病理變化一般膿性、炎性滲出物居多，豬病毒性疾病發病豬病理變化一般以充血、出血、壞死灶為主。
九、病豬出血點變化不同
豬細菌性疾病發病豬出血點變化一般均勻，鮮紅色;豬病毒性疾病發病豬出血點變化一般點狀或斑狀，顏色暗。
十、病豬神經癥狀不同
豬細菌性疾病發病豬一般神經癥狀也有，但較病毒行疾病少見;豬病毒性疾病發病豬一般神經癥狀易出現。
十一、病豬關節變化不同
豬細菌性疾病發病豬關節變化一般腫大，跛行;豬病毒性疾病發病豬關節變化一般軟，不腫。
十二、抗生素使用效果不同
細菌對抗生素敏感，病毒幾乎對現有的抗生素不敏感。
十三、病豬處置方法不同
豬細菌性疾病使用抗生素是首選;豬病毒性疾病首選的是加強護理，適當利用抗生素控制并發癥的發生，不過能有疫苗免疫最好。
